SARS-CоV-2 преодолевает иммунные барьеры путем мутаций

Невозможно влиять на неиснуче

Согласно результатам нового исследования ученых Медицинской школы Университета Питтсбурга (University of Pittsburgh School of Medicine.), США, SARS-CоV-2 в повторяющейся эволюционной модели избегает иммунного ответа макроорганизма, выборочно удаляя отдельные фрагменты своего генетического кода [3]. Учитывая то, что делеция происходит в участках, кодирующих спайк-протеины, антитела, проявляли нейтрализующей активностью, теряют эту способность. При этом молекулярной коррекции таких ошибок репликации вируса не происходит, ведь, по образному выражению авторов исследования, «невозможно исправить то, чего не существует». Итак, мутации закрепляются в генетическом материале уже нового штамма. Статья опубликована в журнале «Science» 3 февраля 2021

История исследования изменчивости SARS-CоV-2

Впервые материалы исследования представлены как препринт в ноябре 2020 С тех пор авторы имели возможность наблюдать реальные проявления описанной закономерности — появление и быстрое распространение миром нескольких новых вариантов SARS-CоV-2. В частности, варианты вирусных штаммов SARS-CоV-2, сначала идентифицированных в Великобритании и Южной Африке, имели делеции указанных участков вирусного генетического кода. Впервые подобные, устойчивы к нейтрализующих антител делеции штамма SARS-CоV-2, обнаружены в образцах пациента с ослабленной имунореактивнисть, течение заболевания у которого завершился летальным исходом в течение 74 дней. Такой длительный период взаимодействия с иммунной системой макроорганизма создает благоприятные условия и раскрывает широкий потенциал изменчивости вирусного генома [1, 2].

Учитывая это следующим шагом исследования стал поиск ответа на вопрос: «Могут ли делеции генетического кода SARS-CоV-2, обнаружены в отдельных пациентов, быть частью широкой тенденции эволюции вируса?». С этой целью исследователями проанализированы базу данных генома SARS-CоV-2, собранных в мире с момента преодоления вирусом межвидового барьера и инфицирования человека. Наблюдение начато учеными в июне 2020, в период, когда геном SARS-CоV-2 считался относительно стабильным. Однако в течение длительного периода анализа новых данных постепенно прослеживалась тенденция явлений делеции, которая проходила в характерных участках генетического кода — локусах, изменчивость которых позволяет варьировать внешнюю форму вируса, не теряя при этом способность проникать в клетки и создавать собственные копии. Итак, эволюция повторялась, и, наблюдая указанную закономерность, исследователи могли прогнозировать будущее сценарий развития мутационных событий.

Среди последовательностей вирусного генома, выделенных группой исследователей под руководством Кевина Р. Маккарти (Kevin R. McCarthy) в октябре 2020, был и B.1.1.7, или так называемый британский штамм. Но в то время этот вариант еще приобрел эпидемиологического значения, и фактически этот вирусный штамм был лишь одним из многих других в перечне выявленных путем анализа мутантных вариантов. Однако, по словам исследователей, обнадеживает то, что указанный штамм все еще сохраняет чувствительность к нейтрализующих антител. По мнению авторов, путь преодоления вирусной изменчивости должен быть сосредоточен на использовании различных типов антител, комбинации нанотил с антителами, применении различных типов вакцин.

Итоги и перспектива

Таким образом, в представленном исследовании предоставлено объяснение того, каким образом SARS-CоV-2 может избегать пагубного влияния ныне разработанных вакцин и других лекарственных средств. Однако остается невозможным точно прогнозировать реализацию таких предусмотренных осложнений, а также того, как долго вакцины, разработанные в настоящее время, будут способны обеспечивать надлежащий уровень защиты от SARS-CоV-2. Поэтому в итогах проведенной работы авторы отметили, что просмотр и разработки новых вакцин следует рассматривать как закономерный шаг на неустанную естественную эволюцию вирусных геномов.

1. Avanzato VA, Matson MJ, Seifert SN et al. (2020) Case study: prolonged infectious SARS-CoV-2 shedding from an asymptomatic immunocompromised cancer patient. Cell, 183 (7): 1901-1912. doi: 10.1016 / j.cell.2020.10.049.
2. Choi B., Choudhary MC, Regan J. et al. (2020) Persistence and evolution of SARS-CoV-2 in an immunocompromised host. N. Engl. J. Med., 383 (23): 2291-2293. doi: 10.1056 / NEJMc2031364.
3. McCarthy KR, Rennick LJ, Nambulli S. et al. (2021) Recurrent deletions in the SARS-CoV-2 spike glycoprotein drive antibody escape. Science, Feb. 3. doi.org/10.1101/2020.11.19.389916.

Н.А. Савельева-Кулик,
Редакция журнала «Украинский медицинский журнал»